Такуя — обычный японский школьник, что на свой телефон получает необычное сообщение. Терзаемый любопытством, он отправляется на указанную в сообщении станцию и садится на поезд. Этот транспорт отправляет главного героя, и ещё четырёх людей, в удивительный цифровой мир, что находится под угрозой уничтожения. За время поездки ребята подружились и решили объединить силы, особенно, когда узнали о собственной миссии.
Цифровой мир захватили дигимоны — своеобразные баги, что имеют необычную форму. Команде требуется найти необычных духов, что дадут им сверхъестественные способности, что помогут спасти другой мир. Их главный враг — Керубимон является самым главным из багов, поэтому он постарается приложить все усилия, чтобы ребята не достигли своей цели.
